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Respositorio del curso "Aprende a utilizar los flujos de análisis bioinformáticos internos del Inmegen"

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INMEGEN/Clase_pipelines

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INMEGEN

Aprende a utilizar los flujos de análisis bioinformáticos internos del Inmegen

Nextflow run with docker

En este curso aprenderás a ejecutar los flujos de análisis bioinformáticos del Inmegen en los equipos de supercómputo del instituto Consulta la información sobre estos flujos aquí

Detalles sobre este curso

Fechas: Lunes 14, miércoles 16, viernes 18, lunes 21 y miércoles 23 de octubre del 2024. Horario: 10 - 14 h

Temario:

  • Repaso de bash
  • Introducción a Nextflow y Docker
  • Cuantificación y análisis de expresión diferencial
  • Identificación automatizada de variantes germinales
  • Identificación automatizada de variantes somáticas
  • Identificación automatizada de variantes de datos de RNA-seq

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Para clonar este repositorio utiliza el comando git clone

git clone https://github.com/INMEGEN/Clase_pipelines.git 

Repositorio pipelines Inmegen

Para clonar el repositorio pipelines Inmegen

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Profesores

Alejandra Cervera Taboada [email protected]

Laura Gómez-Romero [email protected]

Daniel Pérez-Calixto [email protected]

Licencia

Pipelines INMEGEN © 2023 by INMEGEN is licensed under CC BY-NC-SA 4.0

Contacto

Visita nuestro sitio web.

Cualquier duda o comentario escribir a nuestro correo de contacto

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