Skip to content

Transconnectome/k-bfm

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

202 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

🧠 NeuroX: 인지기능 브레인 파운데이션 모델 개발

Important

최종 제안서 협업 문서 (Google Docs) (아이디어 공유 및 제안서 최종 고도화용)

NRF 한국연구재단 과제 제안서 작성 및 연구관리 저장소

Status Grant Period


🎯 프로젝트 개요

NeuroX: 인지기능 브레인 파운데이션 모델 개발

  • 관리번호: 2026-뇌·첨단의공학-01-지정공모-10
  • 그랜트 기관: NRF 한국연구재단 / IITP
  • 연구기간: 2026.04 ~ 2030.12 (5년)
  • 예산: 총 9,736백만원

최종 목표: 다중 모달리티(multi-modal) 뇌-행동 데이터를 통합하여, 개인의 인지기능 및 상태를 해독하는 범용 '뇌 파운데이션 모델' 개발


🚀 빠른 시작

새로 참여하시나요?

👉 **ONBOARDING.md**를 먼저 읽어주세요! (5분)

빠른 링크


📋 핵심 요구사항

필수 성과물

  1. 신규 기능적 뇌활성화 데이터
  2. 표준항목 정의서 (1건)
  3. 파운데이션 모델 (1단계: 1건, 2단계: 1건)
  4. 파운데이션 모델 검증 결과서 (2단계)
  5. 공개형 플랫폼 (2단계)

특기사항

  • K-BDS 등록: 수집된 데이터 및 AI 모델의 K-BDS/K-BDI 등록 필수
  • 국내 클라우드: GPU는 국내 공공클라우드 또는 민간클라우드 우선 활용
  • AI 활용: AI 모델 방식, 컴퓨팅 자원, 데이터 활용 형태 상세 제시 필수

🗂️ 저장소 구조

k-bfm/
├── README.md                    # 이 파일 (프로젝트 개요)
├── ONBOARDING.md               # 온보딩 가이드
├── CONTEXT_*.md                # AI Agent 컨텍스트 (ULTIMATE_PROPOSAL_CONTEXT.md 권장)
│
├── 00_Admin/                   # [New] RFP, 예산, 행정 (Antigravity)
├── 01_Logic_Core/              # [New] 핵심 논리 및 가설 (Gap Analysis)
├── 02_Discovery/               # [New] 문헌 및 멀티모달 증거
├── 03_Evidence_Graph/          # [New] 근거/인용 그래프
├── 04_Drafting/                # [New] 제안서 본문 초안 및 피규어
├── 05_Review/                  # [New] 레드팀 리뷰 및 검증
│
├── docs/                       # 레거시 문서 및 참고 자료
│   ├── 00_task_description/   # RFP
│   ├── 02_literature/         # 문헌 조사
│   └── trash/                 # [New] 보관된 구버전 문서
│
├── scripts/                    # 자동화 스크립트
├── ai_coscientist_src/        # AI CoScientist 시스템
└── data/                      # 데이터셋 메타데이터

자세한 설명은 ONBOARDING.md를 참고하세요.


🎓 핵심 개념 이해

기술적 차별성

  • Connectome-informed Inductive Bias: 뇌의 연결성 정보를 활용한 효율적 모델 설계
  • Swift: 효율성을 위한 Token Pruning & Early Exit
  • Diver: 다양성을 위한 Pluralistic Alignment

3단계 파이프라인

  1. Phase 1 (Foundation): Dual-Stream Pretraining (fMRI + Ephys)
  2. Phase 2 (Alignment): Brain Tuning을 통한 LLM 정렬
  3. Phase 3 (Inference): Neuro-Symbolic Chain-of-Thought

자세한 내용은 CONTEXT_CURSOR.md를 참고하세요.


📚 주요 문서

필수 읽기 (온보딩)

협업 문서 (Google Docs)

  • 👑 K-NeuroMind 제안서 협업 문서
    • 용도: 팀원 간 아이디어 공유 및 제안서 본문 실시간 협업
    • 🔄 지식베이스 연동 가이드:
      1. Google Docs에서 File > Download > PDF Document (.pdf) 선택
      2. docs/03_proposal/references/ 경로에 파일 저장
      3. python3 scripts/kb_ingest.py 실행하여 인덱싱
      4. 이제 AI Agent가 해당 내용을 참조할 수 있습니다.

제안서 작성 (Drafting)

연구 전략

🔑 주요 핵심 레퍼런스 (Key Strategic References)

  • [Nature 2025] Longer scans boost prediction and cut costs (Ooi et al.)

    • 📄 분석 문서 보기
    • Relevance: "Deep Phenotyping" (장시간 고품질 스캔) 중심의 우리 데이터 전략에 대한 수학적/경제적 타당성 제공.
  • [TMLR 2025] Stop Overthinking: Efficient Reasoning (Sui et al.)

    • 📄 분석 문서 보기
    • Relevance: Swift 기술(Efficiency)의 이론적 토대. Big Data 처리를 위한 효율적 연산 근거.
  • [NeurIPS 2025] Brain-tuning Improves Generalizability (Moussa & Toneva)

    • 📄 분석 문서 보기
    • Relevance: Diver 기술(Alignment)의 핵심 레퍼런스. 뇌 데이터를 이용한 Foundation Model 튜닝의 효과 입증.
  • [arXiv 2025] DIVER-1: Deep Integration of Vast Electrophysiological Recordings at Scale

    • 🔗 Paper Link
    • Summary: EEG/iEEG를 위한 대규모 파운데이션 모델. 뇌 데이터의 "Data-constrained scaling laws"를 규명하여, 데이터가 제한적인 상황에서는 큰 모델보다 충분한 에폭(Epoch)으로 학습된 적정 규모의 모델이 더 효율적임을 입증.
    • Onboarding Point: **Phase 1 (Ephys Stream)**의 로드맵이자 Swift 엔진의 확장성 논거.
  • [arXiv 2023] SwiFT: Swin 4D fMRI Transformer

    • 🔗 Paper Link
    • Summary: 4D 시공간 fMRI 데이터를 end-to-end로 처리하는 최초의 Swin Transformer 아키텍처. 고차원 뇌 볼륨 데이터를 효율적으로 처리하여 인지기능 예측 및 뇌 상태 디코딩에서 SOTA 달성.
    • Onboarding Point: **Phase 1 (fMRI Stream)**의 핵심 아키텍처 영감이자 NeuroX-MRI 백본의 기초.

🛠️ 도구 및 스크립트

지식베이스 (Knowledge Base)

# 인덱싱
python3 scripts/kb_ingest.py

# 검색
python3 scripts/kb_query.py "your query"

자세한 내용: knowledge_base/README.md

논문 수집

# 교수진 논문 수집
python3 scripts/collect_papers.py

기타 스크립트

  • scripts/build_rag.py - RAG 시스템 구축
  • scripts/generate_proposal_content.py - 제안서 내용 생성

자세한 내용: scripts/README.md


🤖 AI Agent 사용 가이드

이 프로젝트는 여러 AI agent를 위한 전용 컨텍스트 파일을 제공합니다.

컨텍스트 파일

  • CONTEXT_CURSOR.md: Cursor AI agent용 (SSOT)
  • CONTEXT_CLAUDE_CODE.md: Claude Code agent용
  • CONTEXT_ANTIGRAVITY.md: Antigravity AI agent용

중요 사항

⚠️ 모든 AI agent는 작업 시작 전 반드시 해당 컨텍스트 파일을 읽어야 합니다.

컨텍스트 파일은 다음을 포함합니다:

  • 프로젝트 핵심 비전
  • 3단계 파이프라인
  • 기술적 차별성 (Swift & Diver)
  • 핵심 가설 및 레퍼런스

⚡ AI-CoScientist 워크플로우 트리거 (편의 기능)

복잡한 스크립트를 직접 실행하지 않고, 자연어로 명령하여 AI 엔진을 구동할 수 있습니다. (선택 사항)

트리거 키워드 기능 예시 명령
[심층 조사] 논문 검색 및 분석 "최신 논문 [심층 조사] 해줘"
[제안서 초안] 제안서 초안 생성 "Aim 1 [제안서 초안] 작성해"
[최적화] 학술적 문체로 수정 "이 문단 [최적화] 해줘"
[비평] 레드팀 리뷰 수행 "내 제안서 [비평] 해봐"

상세 가이드: docs/03_proposal/AI_COSCIENTIST_WORKFLOW_GUIDE.md


👥 참여 교수진

  • 차지욱 (Jiook Cha) - 주관연구책임자
  • 심원목 (Won Mok Shim)
  • 김성신 (Sungshin Kim)
  • 홍석준 (Hong Suk Jun)
  • 정천기 (Chun Kee Chung)
  • 정민영 (Minyoung Jung) - KBRI 뇌발달영상연구실
  • 김우중

자세한 연구 배경: docs/01_project_planning/faculty_research/


📝 작업 흐름

1. 문헌 조사

  1. 논문 읽기 및 templates/paper_note.md 템플릿 사용
  2. docs/02_literature/에 저장
  3. 지식베이스 업데이트: python3 scripts/kb_ingest.py

2. 제안서 작성

  1. 핵심 메시지 확인: docs/03_proposal/core_messages.md
  2. templates/proposal_section.md 템플릿 사용
  3. docs/03_proposal/에 저장

3. 연구 계획

  1. templates/work_package.md 템플릿 사용
  2. docs/01_project_planning/에 저장

🔍 현재 상태

완료된 작업

  • 문헌 조사 (50+ 논문 수집 및 분석)
  • 교수진 조사 (6명, 62편 논문 분석)
  • RFP 심층 분석 (평가 기준, 경쟁 환경)
  • 차별화 전략 수립 (핵심 메시지 정립)
  • BT+BBQ 평가 시스템 구축 (22 tests pass)
  • TTS v2 인프라 구축 (9개 스크립트)
  • AI-CoScientist 3 Cycle 완료 (61.4 → 88.0점)
  • 8대 핵심 창의성 100% 반영 (47% → 100%)
  • 연구역량 배점 불균형 해소 (15장 → 16장, Slide 9 신설)
  • 전문가별 프레임워크 매칭 (Porter +3, Doumont +2, Policymaker +2)
  • 16장 통합 슬라이드 완성 (예상 91+점)

진행 중

  • 리허설 (20분 타이밍 검증)
  • PPT/Keynote 제작
  • Q&A 예상 질문 대비
  • 발표 스크립트 최종 정리

자세한 내용: presentation/slides/PROGRESS_REPORT.md


📞 도움이 필요할 때

  1. 온보딩 가이드: ONBOARDING.md 확인
  2. 지식베이스 검색: python3 scripts/kb_query.py "your query"
  3. 템플릿 활용: templates/ 디렉토리 확인
  4. AI Agent: Cursor AI agent에게 질문 (CONTEXT_CURSOR.md 참조) ---## 📄 라이선스 및 기여이 저장소는 NRF K-NeuroMind 과제 제안서 작성 및 연구관리를 위한 내부 저장소입니다.---시작하기: ONBOARDING.md를 읽어주세요! 🚀

About

Neuro-representation learning and Brain Foundation Model (BFM) ecosystem.

Resources

Stars

Watchers

Forks

Packages

 
 
 

Contributors